Metabarcoding de ADN ¿qué es y para qué sirve?

Que no te asuste esta terminología. Te lo explico. Metabarcoding (en inglés) o metabarcodificación de ADN es una técnica que se utiliza en biología molecular y ecología para identificar y caracterizar la diversidad de especies en muestras ambientales a partir de secuencias de ADN.

En lugar de identificar individualmente cada organismo presente en una muestra, la metabarcodificación utiliza fragmentos cortos de ADN conocidos como "códigos de barras" o "barcodes" para identificar múltiples especies simultáneamente en una sola muestra. Estos códigos de barras son regiones específicas del genoma que varían entre especies pero están lo suficientemente conservadas dentro de una misma especie como para permitir su identificación.

El proceso de metabarcodificación implica la extracción de ADN de una muestra ambiental, como por ejemplo suelo, agua, aire o material biológico (heces, plumas o tejidos), seguido por la amplificación de regiones específicas del ADN utilizando técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (quizá te suene más sus siglas, PCR, un término muy común en "tiempos del COVID"). Estas regiones de ADN amplificadas contienen los códigos de barras que se utilizan para identificar las especies presentes en la muestra.

Una vez amplificados, los fragmentos de ADN se secuencian utilizando diversas técnicas de secuenciación, que permiten obtener millones de secuencias cortas de ADN de forma rápida y eficiente. Estas secuencias se comparan luego con bases de datos genéticas de referencia para identificar las especies presentes en la muestra.

Con esta técnica, quedaron atrás los estudios de alimentación de aves basados en el análisis de egagrópilas, por ejemplo, aunque... ¿quién se resiste a desgranar una egagrópila sin saber lo que hay dentro?

ENGLISH VERSION:

Don't let this terminology scare you. Let me explain. Metabarcoding or DNA metabarcoding is a technique used in molecular biology and ecology to identify and characterise species diversity in environmental samples from DNA sequences. Instead of individually identifying each organism present in a sample, metabarcoding uses short DNA fragments known as "barcodes" to identify multiple species simultaneously in a single sample. These barcodes are specific regions of the genome that vary between species but are sufficiently conserved within a species to allow identification. The metabarcoding process involves the extraction of DNA from an environmental sample, such as soil, water, air or biological material (faeces, feathers or tissues), followed by the amplification of specific regions of DNA using polymerase chain reaction techniques (perhaps you are more familiar with its acronym, PCR, a very common term in "COVID times"). These amplified DNA regions contain the barcodes that are used to identify the species present in the sample. Once amplified, the DNA fragments are sequenced using various sequencing techniques, which allow millions of short DNA sequences to be obtained quickly and efficiently. These sequences are then compared with reference genetic databases to identify the species present in the sample. With this technique, studies of bird feeding based on pellet analysis, for example, are a thing of the past, although... who can resist shelling out the DNA sequences of the birds? Who can resist shelling a pellet without knowing what's inside?